蒙巴萨是肯尼亚最重要的港口，海运通达世界各地。
    蒙巴萨也是乌干达-肯尼亚铁路的终点，因此旅游者到蒙巴萨最常见的交通方式是搭乘列车，晚上从内罗毕出发，早上到达蒙巴萨，一、二等车厢是卧铺，设施和服务都相当不错，还供应晚餐和早餐，是省时又省钱的旅行方式。