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    肯尼亚山有两个湿润季节。3月-6月的湿润期较长。12月～2月为短暂的干燥季节。降雨量范围从北方到东南斜坡，由900毫米一直增大到2300毫米。海拔2800米到3800米处常年存在一条降雨云带。大约4500米以上的大部分降水为降雪。雨季峰顶经常白雪覆盖，在冰川上形成一米以上的积雪层。年平均气温变化范围2℃，3～4月最低，7～8月最高。白天气温温差很大，1～2月份约为20℃，7～8月为12℃。空气流动剧烈，整个夜晚直到清晨，风不停地从山上吹下来。从早上到下午空气反方向上升。早上峰顶狂风大作，太阳升起后风速逐渐减小。 

    在肯尼亚山上，植物的种类随着海拔高度的变化也在不断变化。山地森林生长在海拔较低的山坡上，真正的森林带是从海拔2000米处开始分布的，雪松是这里最常见的树木。浓密的竹林则生长在海拔2500米以上的地方，在这一地区有长满苔藓的树木。一片片空地散布在林间。高山和次高山花卉丰富。降雨量875～1400毫米之间，较干旱地区和海拔较低处，非洲圆柏和罗汉松生长占优势。西南和东北较湿润地区（年降雨超过2200毫米）内，柱子红树占优势。概括而言，大多数低海拔地区不在保护区内，用来种植麦子。东南斜坡海拔较高地区（2500～3000米，年降雨超过2000毫米）的优势树种是青篱竹。中海拔地区（2600米～2800米）为竹子和罗汉松混生区。海拔稍高（2600～2800米）或稍低（2500～2600米）处为罗汉松。向山的西面和北面伸展开去，竹子逐渐稀少并失去优势。在海拔2000～3500米，年降水2400毫米的地区，哈根属乔木占优势。海拔3000米以上，主要因为气温低，树高降低。罗汉松让位于金丝桃属树木。由于下层树木更加发达，因而树冠更加张开。青草茂盛的林间空地在山脊上很常见。较低的高山地区或沼泽（3400～3800米）特点是降水多，腐殖质土层厚，地形变化小，植物种类稍欠丰富。从生禾本植物、羊茅及苔草类占优势。丘陵草丛之中生长着斗篷草，老鹳草。较高高山区（3800～4500米）地形变化较大，花卉种类更多，有巨大的莲叶植物，半边莲，千里光，飞廉属植物。土壤排水良好的地方，溪流旁边和河岸处，生长着各类禾本植物。尽管5000米以上的地区还可以发现维管植物，但从大约4500高度起，连绵的植被消失了。